El tráiler nos muestra cómo una madre de familia, Isabella (Reese Witherspoon), habla con su marido por teléfono para saber a qué hora llega su vuelo para ir a recogerlo. Sin embargo, a su llegada al aeropuerto es secuestrado por las autoridades, dejando a su mujer sin la información, esperando noticias del porqué de la no llegada de su marido.

Una de las jefas de Seguridad nacional, llamada Corrine Whitman (Meryl Streep) decide meter en un avión al marido de Isabella enviándolo al norte de África, en donde está el agente de la CIA Douglas Freeman (Jake Gyllenhaal), quien se ocupará de interrogar al “sospechoso” en su primera misión de este tipo. Y sospechoso lo pongo entre comillas porque tratan al acusado como si fuese culpable desde el principio. Todo ello en pos de la seguridad del pueblo norteamericano.

Mientras, Isabella intentará, con la ayuda de un amigo de la universidad que trabaja en el gobierno (Peter Sarsgaard) buscar a su marido, mostrando las pruebas de que su marido iba en ese avión que las autoridades niegan. Su marido es víctima de lo que se llaman entregas extraordinarias del gobierno estadounidense: cualquier persona acusada de terrorismo puede ser enviada a cualquier cárcel en el extranjero.

La única prueba que tienen en contra del acusado son unas llamadas telefónicas recibidas en el móvil, provenientes de un número que perteneció a un terrorista internacional. Lo que ocurre es que los móviles en el mundo árabe pasan de unas manos a otras con rapidez para abaratar costes, por lo tanto el número de móvil de origen puede pertenecer a cualquier persona.

No se puede hacer nada en contra de las autoridades por estos temas, ya que son secreto de estado, por lo tanto la información cae con cuentagotas por los testimonios de los secuestrados, que aportan pruebas de sus secuestros durante meses en el extranjero, y Expediente Anwar es el ejemplo de estas actividades.